Фамилия Сипанова — женская форма, а мужская — Сипанов. В её основе лежит прозвище или нецерковное имя Сипан. Само имя Сипан — почти наверняка усечённая форма от более полного имени, скорее всего, от Сипантий. А Сипантий — это народная, просторечная переделка церковного имени Ипатий (в русской традиции известен как Ипатий Гангрский, святой IV века). Такое «отпадение» начальной гласной — обычное дело в живой речи: из Ипатий получилось Патий, а затем, с уменьшительным суффиксом, — Патюня, Патка. Форма Сипан могла возникнуть под влиянием других имён на Си- (Силантий, Сильвестр) или как результат перестановки звуков.

Модель образования проста: к основе Сипан добавили притяжательный суффикс -ов, означающий принадлежность. Сипанов — «чей?» — сын Сипана. В русских говорах и в документах XV–XVII веков встречаются и другие фамилии от этого корня: Сипачёв, Сипатин, Сипаткин. Все они восходят к тому же источнику — разговорным вариантам крестильного имени Ипатий.

Географически фамилия Сипановы тяготеют к северным и центральным областям России. В переписных книгах XVII века упоминаются крестьяне Сипановы в Вологодском и Тотемском уездах. Встречается фамилия и на Урале, куда переселенцы принесли её в XVIII–XIX веках. В современных справочниках по Архангельской, Вологодской и Кировской областям фамилия фиксируется стабильно, но не массово.

Интересная деталь: в некоторых говорах сипаном называли человека с сиплым, хриплым голосом. Это могло быть и чисто прозвищное имя, не связанное с крестильным. Если в роду были люди с характерной речью, фамилия могла закрепиться и от этой бытовой клички. Но более вероятно церковное происхождение — слишком уж устойчив ряд однокоренных фамилий, восходящих к Ипатию.

Таким образом, предки носителей фамилии Сипанова — это, скорее всего, крестьяне или посадские люди Русского Севера, чьё родовое имя пошло от разговорного варианта имени святого Ипатия.