Фамилия Ситикенова образована от мужской формы Ситикенов, а та, в свою очередь, — от тюркского личного имени или прозвища Ситикен. Основа фамилии — «ситикен» (или «сетикен»), что в ряде тюркских языков (особенно в казахском и башкирском) означает «имеющий сито», «ситовщик» — либо мастера, изготавливающего сита, либо человека, который использовал сито в своём ремесле (например, для просеивания муки или зерна). Слово «сито» в тюркских языках звучит как «сіт» или «сет», а суффикс «-кен» указывает на обладание или склонность к действию. Таким образом, прозвище Ситикен мог получить ремесленник, торговец или просто человек, у которого сито было заметным атрибутом быта.

Фамилия заканчивается на характерный для русского языка суффикс -ов, адаптированный к женскому роду через окончание -а. Это указывает на то, что фамилия формировалась в русскоязычной среде, скорее всего, в XIX–XX веках, когда тюркские имена и прозвища фиксировались в документах по русским канонам. Географически фамилия Ситикенова встречается преимущественно в регионах с тюркским населением: в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской области, а также среди казахов. Встречаемость невысокая, что говорит о локальном происхождении — возможно, от одного родоначальника или небольшой группы семей.

Словообразовательная модель здесь нестандартна: суффикс -ов присоединён к целому тюркскому слову, а не к русскому корню. Это отличает фамилию от более привычных русских фамилий на -ов (типа Кузнецов), где основа — русское слово или имя. В тюркских фамилиях часто встречается такой же суффикс, но основа редко бывает нарицательной вроде «сито». Интересно, что в русском языке слово «сито» имеет древнюю историю, а тюркский аналог «сет» — заимствование из иранских языков, что добавляет фамилии дополнительный культурный слой.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Ситиков, Ситов, Ситикенов — все они восходят к той же основе, но с разными суффиксами. Ситикенова — самая редкая форма, сохранившая исходное тюркское прозвище почти без изменений. Социально носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, так как прозвище указывает на конкретное занятие, а не на знатное происхождение. Дворянских родов с такой фамилией в исторических документах не зафиксировано.