Фамилия Сизин в большинстве случаев происходит от личного прозвища Сизя. В его основе лежит прилагательное «сизый», которое в литературном языке означает «темный, черный с просинью» — так говорят о цвете оперения птиц (сизый голубь) или об иссиня-черных волосах. Однако в псковских и тверских говорах у слова было и другое значение — «бледный, худой». Поэтому прозвище Сизя могло отражать разные черты внешности: либо темные, с синеватым отливом волосы, либо нездоровую бледность и худобу. В любом случае, такое именование давалось по характерной примете человека.

Существует и менее очевидная версия, которая уводит нас на север. Согласно ей, в основе фамилии лежит не прозвище, а мирское имя Сизя, восходящее к коми-пермяцкому слову «сизь» — «дятел». В дохристианской традиции имена от названий птиц и зверей давали с определенной целью: родители хотели, чтобы природа воспринимала ребенка как своего, а ему передались полезные качества избранного представителя животного мира. В случае с дятлом — это, вероятно, трудолюбие и упорство. Однако эта гипотеза выглядит менее вероятной для центральной России, так как требует прямого заимствования из финно-угорских языков, тогда как версия с русским прилагательным объясняет все проще.

Сам суффикс -ин указывает на притяжательную форму: Сизин означает «чей?» — сын, потомок Сизы. Это одна из древнейших моделей образования русских фамилий, характерная для имен и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Стоит заметить, что однокоренные фамилии Сизов и Сизяков образованы от той же основы, но с разными суффиксами, что говорит о широкой распространенности исходного прозвища. Если отбросить редкую коми-пермяцкую версию, то перед нами типичная «внешностная» фамилия: так в старину называли человека смуглого, черноволосого или, наоборот, бледного и худого. Со временем прозвище Сизя закрепилось как основное именование, а его потомки получили фамилию Сизин.