Фамилия Скальчук образована по западноукраинской модели — с суффиксом -чук, который в Поднепровье, на Волыни и в Галичине присоединяли к именам и прозвищам, чтобы назвать сына или ученика. Буквально: «маленький Скалько» или «потомок Скалька». Такая модель массово закрепилась в XV–XVII веках, и Скальчук — типичный пример фамилии, указывающей на родство по мужской линии.

Основа «Скаль-» вызывает споры. Самая прямая версия: прозвище Скалько восходит к украинскому «скала» — скала, утёс. Человека могли прозвать Скалой за твёрдость характера, упрямство или за то, что жил у скалистого обрыва. В говорах Западной Украины «скалою» называли также высокого и худого человека — как скала, торчит. Эта версия правдоподобнее других, потому что прозвища от рельефа местности — один из самых частых источников фамилий на -чук.

Вторая гипотеза — от глагола «скалити» (скалить зубы). Тогда Скалько — человек, который часто ухмыляется, скалозуб. Но в украинской ономастике прозвища от «скалити» обычно давали с другим суффиксом: Скалозуб, Скаленко. Для Скальчука такой корень менее типичен.

Третья, совсем редкая версия — от польского skałka (кремень, огниво). В Польше и на Западной Украине «скалка» означала также каменный осколок, и прозвище могло получить каменотёс или точильщик. Но в этом случае фамилия скорее звучала бы как Скалка или Скалькевич.

Географически Скальчуки чаще всего встречаются в Ровенской, Волынской и Тернопольской областях — то есть в зоне, где суффикс -чук был основным способом образования фамилий. В России фамилия редкая и почти всегда указывает на украинские или белорусские корни предков.

Сословная принадлежность у Скальчуков не закреплена — среди носителей были и крестьяне, и казаки. Поскольку фамилия недворянская (без приставки «фон» или окончания -ский), её носители в основном принадлежали к свободным сельским общинам или казачьим родам.