Фамилия Скалун — редкий пример отфамильного имени, в котором корень указывает на ландшафт, а не на профессию, имя или внешность. В русских фамилиях основа «скал-» встречается нечасто: гораздо привычнее Каменев, Горыныч, Утёсов. Скалун же сразу отсылает к чему-то твёрдому, неподвижному, возможно, даже угрюмому.

Словообразовательная модель здесь простая: корень «скал-» плюс суффикс «-ун». В русском языке суффикс «-ун» образует имена существительные со значением лица по характерному действию или свойству: бегун, крикун, хвастун, говорун. Если приложить эту модель к «скале», получится «тот, кто похож на скалу» — не в прямом, а в переносном смысле: человек твёрдый, несгибаемый, упрямый, либо же молчаливый и суровый. Прозвище Скалун могли дать в крестьянской или казачьей среде за непоколебимый нрав.

Есть и вторая, более бытовая версия: фамилия могла возникнуть от географического прозвища человека, жившего у скалы или на каменистой возвышенности. В говорах северных и уральских областей «скала» — не обязательно отвесный утёс, а любой выход камня на поверхность. Скалуном могли назвать того, чей дом стоял на скале или кто пас скот на скалистом участке. Модель «место жительства + суффикс принадлежности» для русских фамилий типична, но здесь она работает не с топонимом, а с прозвищем.

Фамилия не дворянская и не книжная — она явно народная, скорее всего, из среды черносошных крестьян или однодворцев. Встречается она преимущественно на юге России и в Сибири, куда переселенцы приносили прозвища с собой. В дореволюционных метрических книгах Скалуны фиксировались в Воронежской и Курской губерниях, реже — на Урале. При этом фамилия не получила широкого распространения и осталась довольно редкой, что только подтверждает её локальное, прозвищное происхождение.

Интересно, что у Скалуна нет однокоренных «братьев» с тем же суффиксом: Скалов, Скалкин, Скальский — все они образованы по другим моделям. А вот Скалун стоит особняком, и это делает фамилию хорошим маркером для генеалогического поиска: если вы встретили Скалуна в документах XIX века, скорее всего, это выходец из одного конкретного села или группы сёл, а не носитель «бродячего» прозвища.