Фамилия Скаргачева — женская форма фамилии Скаргачев, а та, в свою очередь, образована от прозвища или мирского имени Скаргач. Основа здесь — древнерусское слово «скарга», которое в разных говорах означало «жалоба», «плач», «ссора», а также «тяжба» или «судебное дело». Человек, получивший такое прозвище, мог быть либо сварливым, склонным к бесконечным жалобам, либо, наоборот, профессиональным челобитчиком — тем, кто вёл чужие тяжбы в суде. В XVI–XVII веках на Руси таких людей называли «скаргами» или «скарговниками», и это была не столько бранная кличка, сколько указание на род занятий.

Модель образования фамилии типична для северных и центральных областей России: суффикс -ев присоединялся к основе на мягкий согласный (Скаргач → Скаргачев). В отличие от фамилий на -ин, которые образуются от основ на -а/-я, здесь сработала модель отчества от прозвища с конечным -ч. Интересно, что фамилия Скаргачева встречается преимущественно в Вологодской, Архангельской и Костромской областях — именно в этих краях слово «скарга» было особенно употребительно и сохранилось в местных говорах до XX века.

Любопытно, что в польском языке «skarga» означает то же самое — «жалоба», и там существует фамилия Скарга (Skarga), известная по иезуиту Петру Скарге. Однако русская фамилия Скаргачев, скорее всего, имеет исконное восточнославянское происхождение, а не польское заимствование: корень общеславянский, и на Русском Севере он бытовал независимо. Встречается также вариант написания Скоргачев (с буквой «о»), что связано с аканьем или диалектным произношением.

Таким образом, предки носительницы фамилии Скаргачева — скорее всего, не знатные люди, а крестьяне или посадские, жившие в Поморье или Заволжье. Прозвище могло закрепиться за родом, где кто-то из предков был известен как жалобщик, сутяжник или, наоборот, как человек, помогавший другим составлять челобитные.