Фамилия Скелин звучит редко и немного отрывисто, но за ней стоит целый веер возможных значений. Прозвище Скеля, от которого она образована, в русских говорах означало «скала, каменистая круть, скалистый берег». Отсюда первая, самая прямая версия: так могли прозвать человека под стать горе — рослого, крепкого, несокрушимого, либо того, кто жил у скалистого берега. Но у того же корня есть и другой, более колоритный смысл — «скельник», то есть отшельник, поселившийся в береговой пещере. В этом случае прозвище указывало бы на аскетичный образ жизни предка, на его отстранённость от мирской суеты.

Однако есть и «профессиональная» версия, которая уводит нас от береговых скал к воде. В хорватском языке слово «скела» означает «паром» — плоскодонное перевозочное судно с помостом, которое двигалось греблей или по канату. Если принять эту версию, то Скеля — это типичное «профессиональное» именование: так могли назвать либо самого паромщика, либо хозяина и содержателя переправы. В старину такие прозвища часто закреплялись за человеком по роду его занятий и переходили к детям, постепенно превращаясь в фамилию.

Менее убедительной выглядит гипотеза, что в основе лежит хорватское слово «скеле» — «строительные леса». По этой логике Скелей могли окрестить строителя или плотника, работавшего на лесах. Но эта версия проигрывает двум первым хотя бы потому, что требует допущения о заимствовании термина, который в русской среде был малоупотребителен. Куда естественнее предположить, что прозвище либо описывало внешность и характер человека (скала, отшельник), либо указывало на его ремесло (перевозчик).

Как бы то ни было, потомки человека по прозвищу Скеля со временем получили фамилию Скелин. Модель образования здесь классическая: к основе на -я добавляется притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Скелин сын, внук). Такая схема типична для русских фамилий, образованных от прозвищ с конечным -а/-я, и она же подсказывает, что фамилия закрепилась в среде, где преобладала именно эта словообразовательная традиция.