Фамилия Скиртин — одна из тех, где прозвищная основа настолько прозрачна, что вопрос «откуда?» решается сразу, но за этой прозрачностью скрывается неочевидная география и социальный фон. Разговорное слово «скирт» или «скирда» — это плотно уложенная куча сена, соломы или снопов, продолговатой формы. Человек, получивший такое прозвище, мог быть крестьянином, работавшим на сенокосе, либо владельцем большого стога — в переносном смысле «скирдой» называли грузного, плотного человека. Ономастический словарь Веселовского фиксирует похожие прозвища: Скирда, Скирдин — и все они из северных и центральных губерний, где сенокос был основой хозяйства.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Скиртин — «сын Скирты». В русской модели фамилий на -ин обычно образуются от основ на -а, -я, так что исходная форма прозвища — Скирта. Важно не путать с фамилией Скирдов (от «скирд» мужского рода) или Скирдовский (польско-украинская версия). Скиртин — вариант именно от женского по форме прозвища, что типично для северных говоров, где аканье и окончание -а в мужских прозвищах было нормой.

Встречается фамилия преимущественно в Вологодской, Архангельской и Костромской областях — это зона традиционного северного сенокошения. В XIX веке носители Скиртиных числились в основном государственными крестьянами, реже — мещанами. Никакой дворянской ветви у фамилии нет, что логично: профессия скирдовальщика или владельца стога — занятие сугубо крестьянское. Известных деятелей культуры или науки с такой фамилией нет, но сама фамилия устойчиво держится в сельской местности до сих пор.

Есть и редкая версия, что Скиртин могло быть прозвищем от диалектного «скиртать» — «греметь, шуметь» (в рязанских говорах). Но она менее правдоподобна, так как ареал фамилии не совпадает с рязанским регионом. Так что основная версия — сено и крестьянский труд — остаётся самой надёжной.