Фамилия Сколотин образована от прозвища Сколота, а оно, скорее всего, восходит к глаголу «сколоть» — то есть сбить, отколоть, снять верхний слой. В русских говорах это слово имело и конкретные ремесленные значения: так могли называть того, кто сбивал масло, откалывал щепу при изготовлении деревянной посуды или даже занимался рубкой мяса. Прозвище могло закрепиться за человеком по роду занятий — например, за бондарем или маслоделом.

Менее вероятна, но всё же возможна связь с диалектным «сколотный» — сварливый, неуживчивый человек. В таком случае прозвище носило характер оценки, а не профессии. Обе версии укладываются в типичную модель русских фамилий на -ин, которые образовывались от прозвищ на -а: Сколота → Сколотин, то есть «сын Сколоты» или «человек из рода Сколоты».

Фамилия встречается в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской и Архангельской губерниях, где было развито маслоделие и деревообработка. Это косвенно подтверждает «ремесленную» версию. В писцовых книгах XVI–XVII веков можно найти упоминания крестьян с подобными прозвищами, хотя сама фамилия Сколотин в дворянских родословных не значится — её носители были, скорее всего, из крестьян или посадских людей.

Стоит отличать её от фамилии Сколотнев, которая образована от прилагательного «сколотный» (тот самый сварливый) с другим суффиксом. Сколотин же — более «вещная» фамилия, связанная с конкретным действием, а не с характером. В современной России она редкая, но не исчезнувшая: носители встречаются в основном на севере и северо-востоке европейской части страны.