Фамилия Скубято — редкий случай в русском ономастиконе, так как её окончание -о не типично для восточнославянских фамилий, а скорее напоминает украинские или белорусские формы. Однако корень слова почти наверняка связан с глаголом «скубти» (дёргать, выщипывать, теребить). В белорусском и украинском языках «скубя» или «скубе» — форма настоящего времени от этого глагола, а суффикс -то мог закрепиться как прозвищное окончание. Таким образом, Скубято — это, скорее всего, прозвище человека, которое позже стало фамилией.

Что могло лежать в основе прозвища? Первая версия — профессиональная. Скубято могли называть того, кто занимался обработкой льна или пеньки: «скубці» означало трепать, очищать волокно. Вторая, более бытовая версия — прозвище по привычке или внешности: «скубято» могло относиться к человеку, который постоянно теребил что-то в руках, дёргал себя за бороду или одежду. Третья версия — прозвище по характеру: «скубято» могли дать придирчивому, «щиплющему» человека по мелочам.

Словообразовательная модель фамилии необычна. Суффикс -то (вместо более привычных -ов, -ин, -ский) встречается в основном в западных регионах бывшей Речи Посполитой — на территории современной Беларуси, Украины, а также в польском языке (сравните с польскими фамилиями на -to). Это указывает на то, что фамилия Скубято могла сформироваться на землях, где смешивались восточнославянские и западнославянские языковые традиции. Географически такие фамилии чаще всего встречаются в Гродненской, Брестской областях Беларуси и на Волыни в Украине.

Спорных версий здесь немного. Некоторые могут пытаться связать фамилию с литовским корнем (skub- «спешить»), но это маловероятно, так как глагол «скубці» — общеславянский, а литовское влияние в этом регионе не дало такого прямого совпадения. Единственная альтернатива — что прозвище произошло от диалектного названия птицы (например, «скуб» — вид совы), но это слабая гипотеза без документальных подтверждений.

В итоге, предки человека с фамилией Скубято — скорее всего, крестьяне или ремесленники из западных земель бывшего Великого княжества Литовского, где прозвище по действию или ремеслу закрепилось в необычной форме. Фамилия не дворянская, не искусственная (семинарская), а чисто бытовая, что делает её особенно ценной для изучения народной ономастики.