Фамилия Скубенко звучит на украинский лад, но корень у неё — древний, восточнославянский, и ведёт он не к имени, а к прозвищу. В его основе лежит диалектный глагол «скубти», который в смоленских, псковских и саратовских говорах означал «щипать, прясть», «скоблить, ощипывать птицу, драть за волосы, скубить кудель волокна», а в курских — «чесаться». Уже из этого перечня видно, что прозвище Скубенко могло указывать и на ремесло, и на характер.

Скорее всего, предок обладателя этой фамилии занимался прядением нитей, изготовлением ткани или обработкой шкур — работа, требовавшая постоянного «скубения», то есть ощипывания и выдирания волокна. Но не менее вероятно, что прозвище прилипло к повару, который ощипывал птицу. А ещё так могли прозвать непоседливого, озорного человека — того, кто постоянно лезет в драку, «дерется за волосы», или просто егозу, которому неймётся.

Суффикс -енко, типичный для украинских фамилий, указывает на «сына» или «потомка» человека с прозвищем Скубенко. Сама фамилия закрепилась, скорее всего, на территории современной Украины или в южнорусских землях, куда переселенцы принесли и прозвище, и модель его оформления.

Родственные фамилии встречаются в документах с XVI века. Степан Веселовский в своих ономастических трудах упоминает новгородского крестьянина Скубило (1495 год) и рязанского крестьянина Андрея Скубятина, он же Скубятев (1530 год). Эти примеры показывают, что корень «скуб-» был распространён по всей Руси, но в Скубенко он закрепился именно через уменьшительно-ласкательную форму, что делает фамилию одновременно и профессиональной, и прозвищной.

Если ваш предок носил фамилию Скубенко, он мог быть и мастеровитым ремесленником, работающим с льняным волокном или кожей, и просто человеком с живым, задиристым нравом. Точного ответа уже не даст никто, но оба пути ведут к одному: прозвище было цепким, ярким и точно отражало то, что видели в человеке окружающие.