Фамилия Слышенко — яркий пример украинской модели фамилий с суффиксом -енко. На востоке Украины, в частности на Полтавщине, Слобожанщине и в Приднепровье, такие фамилии в XVI–XVIII веках массово давали детям, обозначая их как «маленького» или «сына» носителя прозвища. В данном случае основа — «Слышен» или «Слышный». Это не имя, а прозвище: так могли назвать человека с острым слухом, который всё слышит, или, наоборот, того, кто сам громко говорит, «слышен» издалека. Встречается и более прозаичная версия: на южнорусских говорах «слышный» означало «известный, видный», то есть прозвище могло указывать на заметного, уважаемого человека.

Есть и вторая, менее вероятная гипотеза — от канонического имени Сысой (разговорная форма Сыс, Сыско). Однако звуковой переход «Сыс» → «Слыш» фонетически спорен: в украинском языке «и» не переходит в «л» без особых диалектных условий. Правдоподобнее считать, что корень чисто прозвищный, от глагола «слыть» или «слышать».

С точки зрения географии, фамилия Слышенко сегодня встречается преимущественно в центральных и восточных областях Украины, а также среди потомков переселенцев на Кубани и в Ставрополье. В России её носители редки и чаще всего имеют украинские корни по линии предков. Сословная принадлежность у этой фамилии не закреплена: её носили и казаки, и крестьяне, и мещане — суффикс -енко в XVII–XVIII веках уже не был привилегией только знати, а стал массовым семейным маркером.

Любопытная деталь: в отличие от фамилий Слышков или Слышаев (с русскими суффиксами), Слышенко сохранила типично украинскую огласовку и ударение на втором слоге — Слыше́нко. Встречаются варианты написания через «и» (Слишенко) — это влияние южнорусского аканья или ошибки в документах XIX века, когда писарь записывал фамилию на слух.