Фамилия Смалковская — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно присмотреться к основе «Смалк-» и суффиксу «-овск-», который типичен для фамилий польского и западнорусского дворянства. Скорее всего, это фамилия по названию места — Смалково или Смальково. Такие топонимы встречаются в Беларуси и на западе России (например, деревня Смальково в Смоленской области). Житель или владелец такого селения получал прозвание «Смалковский», а его потомки закрепили фамилию в женской форме — Смалковская.

Корень фамилии, вероятно, связан со словом «смала» (смола) или «смальний» (смоляной). В старину смолу добывали в лесах, ею смолили лодки и телеги. Прозвище Смалко могли дать человеку, который занимался смолокурением — ремеслом, распространённым в лесных регионах. Возможна и другая версия: основа «Смалк-» могла быть вариантом имени Смаль — краткой формы от христианского имени Смарагд (др.-греч. «изумруд»), но это менее вероятно, так как имя это было редким.

Суффикс «-ск-» в сочетании с «-ов-» указывает на шляхетское или, по крайней мере, привилегированное происхождение. В Речи Посполитой и на западе Российской империи такие фамилии носили мелкопоместные дворяне, которые брали фамилию по названию своего имения или деревни. Однако это не гарантирует, что все носительницы фамилии Смалковская — потомки знати: крестьяне, переселявшиеся из деревни Смалково, тоже могли со временем получить эту фамилию через прозвище.

В написании фамилии встречается вариант через «о» — Смолковская, что прямо указывает на связь со смолой. Если ваши предки родом с территории современной Беларуси или Смоленщины, то ремесло смолокура или жизнь в селении с таким названием — самая реалистичная версия. Фамилия нечастотна, поэтому точную географию её бытования можно проследить по архивным записям метрических книг XIX века — скорее всего, она сосредоточена в западных губерниях.