Фамилия Смалковский — редкий пример, где окончание -ский не указывает на польское или украинское происхождение, а скорее скрывает за собой чисто русскую основу. Вопреки первому впечатлению, корень здесь не в польском «смалы» (маленький), а в глаголе «смалковывать» — устаревшем слове, означавшем «сбивать масло», «пахтать» или, в переносном смысле, «толочь воду в ступе», заниматься пустым делом. Отсюда прозвище Смалок — человека, чья работа была связана с маслобойным промыслом, или же, с ироничным оттенком, болтуна и пустомели.

Суффикс -овск- в русской традиции часто присоединялся к прозвищам, образуя фамилии по модели «чей?»: Смалок → Смалковский, то есть «сын Смалка». Такая модель встречается в северных и центральных губерниях России, где фамилии на -ский нередко возникали не от географических названий, а от личных прозвищ или профессий. Например, однокоренные фамилии Смалков, Смальков, Смаль встречаются в архивных записях по Тверской и Вологодской губерниям — там маслоделие было традиционным промыслом.

В польском языке существует фамилия Smołkowski, связанная с названием смолокурни (smoła — смола), но русский вариант Смалковский, скорее всего, не имеет к этому отношения. Разница в гласной (а против о) и отсутствие исторических связей с польскими землями указывают на самостоятельное происхождение. Встречаемость фамилии невысока: по данным современных переписей, большинство носителей живут в России, а не в Польше или Беларуси.

Таким образом, Смалковский — пример того, как внешне «шляхетское» окончание скрывает за собой крестьянское прозвище, связанное с повседневным трудом. Предок носителя этой фамилии мог быть маслобойщиком или просто человеком, за которым закрепилось насмешливое прозвище Смалок. Фамилия не попала в широкие ономастические словари, что делает её изучение в основном архивной задачей.