Фамилия Смалкова — женская форма фамилии Смалков, и её происхождение напрямую связано с прозвищем Смалок. В отличие от многих фамилий на -ов/-ев, образованных от полных крестильных имён, эта фамилия отталкивается от мирского прозвища, которое могло быть образовано от глагола «смали́ть» — жечь, опалять, смолить. Человек мог получить прозвище Смалок за род занятий: смолокур, выжигатель древесного угля, или за привычку стоять у огня, возиться с сажей и гарью. В северных и центральных говорах «смали́ть» означало также «палить шерсть» или «смолить лодки», так что предок мог быть ремесленником, связанным с обработкой кожи, дерева или металла.

Словообразовательная модель проста: к основе Смал- добавился суффикс -ок, характерный для уменьшительно-пренебрежительных или профессиональных прозвищ (ср. Рыбак, Сечок, Живок). Затем по патронимическому принципу — притяжательный суффикс -ов — фамилия закрепилась за потомками: «чей?» — Смалкова сына стали звать Смалковым. Важно, что фамилия не имеет отношения к «смальце» (жир) или «сма́льте» (краска) — это внешнее звуковое совпадение.

Географически фамилия Смалкова встречается в основном в центральных и северных областях России, особенно в Тверской, Вологодской и Костромской губерниях, где смолокурение и лесные промыслы были распространены до XX века. Встречаются и варианты написания — Смальков, Смольков, но они могут указывать на разные диалектные произношения. Сословно носители фамилии почти всегда были крестьянами или мещанами, реже — однодворцами.

Споров о корне немного: большинство ономастов (в том числе Б. Унбегаун в «Русских фамилиях») относят такие фамилии к профессиональным прозвищам. Менее вероятная версия — от имени Смал как сокращения от Смарагд (древнерусская форма имени изумруд), но она не подкреплена источниками и встречается крайне редко. Так что если вы носитель фамилии Смалкова, скорее всего, ваши предки были людьми, чья жизнь была тесно связана с огнём и ремеслом.