Фамилия Сонкина — женская форма фамилии Сонкин, и её разбор стоит начать с суффикса -ин. Этот патронимический суффикс, один из самых распространённых в русской ономастике, указывает на принадлежность: «чей?» — Сонкин, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Сонка. Основа здесь не от слова «сон», хотя такое предположение напрашивается первым.

Сонка — это уменьшительно-ласкательная форма от крестильного имени Созонт (или Созон, Созонтий). В просторечии имя, пришедшее из греческого (сотер — «спаситель»), сокращалось до Соня, а затем обросло типичным для русских говоров суффиксом -ка, дающим фамильярно-ласковый оттенок. Таким образом, исходное значение фамилии Сонкин — «потомок Сонки», то есть человека, которого в быту звали уменьшительным от Созонта. Вторая, менее вероятная версия, связывает Сонку с прозвищем от диалектного глагола «сонить» (бредить, говорить во сне или, в некоторых говорах, дремать), но имя Созонт в качестве источника надёжнее и подтверждается тем, что фамилия встречается в регионах, где имя было популярно, — например, в северных и центральных губерниях.

Интересная деталь: фамилия Сонкина, в отличие от более частых Сониных и Сонькиных, сохранила именно форму Сонка, а не Соня, что характерно для окающих говоров (Вологда, Архангельск, Кострома). В таких регионах безударное «о» произносилось чётко, поэтому «Сонка» не смешивалась с «Сонькой». Социально носители фамилии, скорее всего, относились к крестьянскому или мещанскому сословию — патронимы на -ин у дворян встречались реже, чем на -ов, но в среде простых людей были нормой. Современные носители фамилии Сонкина могут с высокой вероятностью иметь предков из северной или центральной части России, где имя Созонт бытовало до начала XX века.