Фамилия Сойников в основе своей имеет прозвище Сойник. В старину так называли место, открытое солнцу, — дом, стоявший на припеке, где тень бывала редко. Человек, живший в таком месте, вполне мог получить прозвище Сойник, которое затем закрепилось за его потомками как фамилия. Эта версия — самая прямая и правдоподобная: она опирается на нарицательное слово, которое действительно бытовало в народной речи.

Не исключено, что прозвище могло быть связано и с названием населённого пункта. Однокоренные топонимы встречаются в славянских землях, и основатель рода Сойниковых мог быть выходцем из местности с таким именем. В этом случае фамилия отвечала бы на вопрос «откуда человек», а не «каков он».

Существует и менее очевидная гипотеза, уводящая в финно-угорскую среду. Согласно ей, в основе лежит имя Соиник — диалектальный вариант имени Сейни, которое переводят как «сердечный». Так могли назвать долгожданного, любимого ребёнка. Версия любопытная, но менее убедительная: она требует допущения о заимствовании имени в русскую среду, тогда как славянское «сойник» лежит на поверхности и не нуждается в дополнительных построениях.

Как бы то ни было, фамилия Сойников образована по обычной для русских фамилий модели: к основе на -ник добавили притяжательный суффикс -ов, означавший принадлежность потомку. Со временем форма «Сойников» застыла и перестала осознаваться как «сын Сойника», превратившись в родовое имя.