Фамилия Спирюгов — редкая, и её разговорная форма сразу выдаёт основу: перед нами вариант фамилии Спиридонов, но с характерным усечением имени. В основе лежит каноническое имя Спиридон (от греческого «спиридион» — корзиночка, плетёная корзинка). На Руси его часто переделывали в Спиря, Спирюха, Спирюня — и именно от этой простонародной формы Спирюг (с суффиксом -юг, который даёт фамилии оттенок уменьшительности или пренебрежения, как в словах «парнюга», «дружок») образована фамилия притяжательным суффиксом -ов: Спирюгов, то есть «сын Спирюга».

Главная особенность — суффикс -юг в основе. В русских фамилиях он встречается нечасто, в основном в северных и вологодских говорах, где -югами называли молодых парней или просто людей с экспрессивной окраской. Поэтому фамилия Спирюгов почти наверняка родом из северорусских земель (Архангельская, Вологодская губернии) или из Поволжья, куда переселялись северяне. Встречается она и в варианте Спирюков (с суффиксом -юк, типичным для украинского и южнорусского влияния), но Спирюгов — это чисто великорусская модель.

Ономастических трудов, напрямую разбирающих эту фамилию, нет, но она хорошо ложится в схему, описанную Б. Унбегауном: от разговорной формы имени плюс редкий суффикс. Версия о происхождении от прозвища Спирюга (например, от глагола «спириться» — ссориться, или от «спиридон» в значении «хитрец») менее вероятна: имя Спиридон было настолько распространено, что перекрывает любые прозвищные гипотезы.

Сословно фамилия скорее всего крестьянская или мещанская: в дворянских родословных книгах она не фиксируется. Носители Спирюговых — это потомки тех, кого в быту звали Спирюгами, то есть Спиридонами, но с местным диалектным произношением. Сегодня фамилия крайне редка, встречается точечно в Вологодской и Кировской областях, а также среди староверов, которые сохраняли архаичные прозвища.