Фамилия Стаковенков — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а, скорее всего, прозвище, образованное от диалектного глагола. Главная загадка здесь — корень «стак-». В русских говорах слово «стакать» означало «соединять, складывать, подгонять одно к другому» (отсюда и «стакан» — склеенное из дощечек изделие). Соответственно, прозвище Стакан или Стаков мог получить человек, который что-то подгонял, монтировал, собирал, или же, в переносном смысле, умелый посредник, «стакающий» людей.

Вторая версия, менее вероятная, но встречающаяся в ономастике, — связь с литовским или белорусским словом «stakas» (стог, копна). В этом случае прозвище могло указывать на крестьянина, занимавшегося сенозаготовкой, или на человека плотного, коренастого телосложения.

Модель образования типична для восточнославянских фамилий: к основе «Стаков» (чей? — сын Стака) добавился патронимический суффикс -енк(о), характерный для украинских и южнорусских фамилий, а затем уже на русской почве его «обрусили» суффиксом -ов, получив двойную фамильную примету: Стаков-енк-ов. Такая «тройная» конструкция (корень + украинский суффикс + русский суффикс) нередко встречается в пограничных областях — на Слобожанщине, в Курской, Воронежской, Белгородской губерниях, где смешивались украинская и русская традиции имяобразования. Таким образом, предок носителя этой фамилии — скорее всего, выходец с южнорусских или украинских земель, которого в более северных районах прозвали по отцу «Стаковенком», а потом закрепили фамилию в привычной русской форме. Фамилия редкая, в списках массовых дворянских или купеческих родов не значится — вероятнее всего, крестьянского или мещанского происхождения.