Фамилия Стаматин — редкий случай, когда географический корень почти наверняка перевешивает любые другие версии. В основе лежит греческое имя Стаматис (Σταμάτης), сокращённая форма от Стаматиос — «останавливающийся», «прекращающий». В греческой традиции это имя давали в честь святого, но в русском контексте фамилия закрепилась не через церковные святцы, а через живые контакты.

Модель образования проста: греческое личное имя Стамат (или Стамати) + русский патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей?» — Стаматин, то есть сын Стамата. Суффикс -ин, а не -ов, типичен для основ на -а/-я, что подтверждает греческое происхождение исходного имени.

Главный ключ к фамилии — её география. Стаматины почти не встречаются в центральных русских областях, зато плотно представлены на юге России, особенно в Краснодарском крае и Ростовской области. Это зона, куда в XVIII–XIX веках переселялись греки из Османской империи, спасаясь от преследований. Предки Стаматиных были, скорее всего, греческими колонистами, которые оседали в Причерноморье и Приазовье. Фамилия не получила массового распространения, поэтому её носители — потомки довольно компактной группы переселенцев.

Иногда фамилию пытаются связать с молдавским словом «стамат» (настойка, бальзам), но это маловероятно: молдавские фамилии обычно образуются с суффиксом -еску или -ук, а не -ин. Греческая версия и по лингвистике, и по истории заселения юга России выглядит единственно убедительной.