Фамилия Судомора — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка было двухкоренным, причём оба корня вполне прозрачны: «суд» и «мор». Первое, что приходит на ум — связь с судебным разбирательством и смертью. Но не спешите видеть в предке жестокого палача или судью, выносящего смертные приговоры.

Скорее всего, прозвище Судомора относилось к человеку с тяжелым, «смертным» нравом, которого опасались, или к тому, кто прослыл забиякой и спорщиком, чьи ссоры и тяжбы доводили до крайности. В народной речи «судить» часто означало не только официальное разбирательство, но и просто браниться, корить, осуждать. А «мор» — это гибель, погибель, разорение. Таким образом, Судомора — человек, чьи суды (склоки, тяжбы) несут разорение и беду. Это не столько профессиональная характеристика, сколько социальная оценка — так могли прозвать неуживчивого, злого соседа или даже недобросовестного судейского чиновника, который «морит» тяжущихся.

Версия о происхождении от географического названия (например, реки или урочища) маловероятна: топонимов с таким корнем в известных источниках не зафиксировано. Не стоит также искать здесь украинские или польские корни — суффикс -а в прозвище Судомора типичен для русской модели образования прозвищ от глагольных основ (как Гуляй-город, Держи-морда).

Сама фамилия оформлена по архаичной модели: прозвище в чистом виде, без суффикса -ов/-ев, -ин. Это так называемая «застывшая» форма родительного или именительного падежа, которая не склоняется по падежам как типичные русские фамилии (Судомора, Судоморе, Судомору). Такие фамилии чаще встречались в южных и западных регионах России, а также в среде казачества, где прозвища нередко переходили в фамилии без изменений.

Встречаемость фамилии крайне низкая. Основной ареал — центральные области России, единичные носители есть на Украине. Сословная принадлежность предков, скорее всего, крестьянская или однодворческая — фамилия не имеет признаков дворянского или духовного происхождения.