Фамилия Суганов образована от прозвища или имени Суган. В её основе лежит тюркское слово «суган» — «лук» (растение). Носитель такого прозвища мог быть огородником, торговать луком или просто выделяться какой-то внешней чертой, которую окружающие связывали с этим растением. Модель типична для русских фамилий на -ов: суффикс присоединялся к основе, указывая на принадлежность «сын Сугáна» или «из рода Сугáновых».

Менее вероятна, но возможна связь с бурятским или монгольским именем Суга (в значении «светлый», «ясный»). В таком случае фамилию могли получить потомки человека с этим именем, а русский суффикс -ов добавился при адаптации в документах. Однако географическое распространение фамилии говорит скорее в пользу первой версии: Сугановы чаще встречаются в Поволжье и на Урале — в зоне активных контактов русских с татарским и башкирским населением.

Ударение в фамилии — на втором слоге: Сугáнов. Встречается также вариант Сугáнова. Родственные фамилии — Сугаков, Сугарев, Сугатов — образованы от тех же корней, но с разными суффиксами, что говорит о разнообразии прозвищной основы в прошлом. В дореволюционных переписях носители фамилии числились в основном крестьянами и мещанами, никаких дворянских родов Сугановых не зафиксировано.