Фамилия Сухер — редкий случай, когда основа не лежит на поверхности и не даёт однозначной подсказки. Её происхождение нужно искать не в русском слове, а в именах и прозвищах из соседних языков.

Вероятнее всего, фамилия восходит к крестильному имени. В основе лежит вариант еврейского имени Сахер или Зехарья (библейский Захария — «помнящий Бога»). В восточноевропейской традиции, особенно в среде ашкеназов, имя могло сокращаться до Сухер. Суффикс в фамилии отсутствует: модель образования здесь не патронимическая (типа Сухеров), а чистая основа, что характерно для фамилий, которые фиксировали прозвище или имя без дополнительного оформления. Такая форма встречается среди еврейских фамилий, записанных в XIX веке на территориях бывшей Речи Посполитой и Российской империи.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая, — немецкое происхождение. В немецком языке Sucker или Sucher означает «ищущий», «сыщик», а в диалектах — «сосунок» или «молокосос». Однако написание «Сухер» с «х» вместо «к» или «ch» говорит о том, что фамилия осваивалась через славянскую фонетику. Если бы она была немецкой, мы чаще встречали бы вариант Зухер или Зукер.

Географически фамилия тяготеет к западу бывшей Российской империи: Волынь, Подолье, Бессарабия. В этих регионах в XIX веке активно смешивались еврейское, украинское, польское и немецкое население, и фамилия Сухер могла возникнуть на стыке культур.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Сухеров, Сухор, Сухарев — ничего не даёт, так как у них другая основа (от «сухой»). Сухер стоит особняком. Это не фамилия крестьянина или ремесленника из центральной России, а скорее след миграции и адаптации личного имени в многоязычной среде.