Фамилия Султонова — вариант написания, который сразу указывает на её нерусское происхождение. В исконно русских фамилиях сочетание «лт» встречается редко, а ударный суффикс «-ов» здесь присоединён к основе, явно заимствованной из тюркских языков. Перед нами женская форма фамилии Султонов, которая образована от мужского имени Султон — тюркской и таджикской версии арабского титула «султан» (властитель, правитель). В дореволюционной Средней Азии и Поволжье это имя давали не только знати: среди простых мусульман оно символизировало пожелание силы и уважения, как русское имя Князь в редких случаях.

Словообразовательная модель проста: к основе «Султон» добавлен русский патронимический суффикс «-ов», который в XIX–XX веках активно использовался при русификации фамилий нерусских народов Российской империи. Это не означает, что предки были дворянами или потомками султанов. Чаще всего фамилию получали по отцу: если отца звали Султон, то его дети в документах записывались как Султоновы. Встречается и вариант с суффиксом «-евич» (Султонович), но он гораздо реже.

Географически фамилия Султонова распространена в Таджикистане, Узбекистане, среди татар и башкир, а также в ряде регионов России с тюркским населением (Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область). В русских переписях XVII–XVIII веков она не фиксируется — это поздняя фамилия, возникшая не раньше середины XIX века, когда начался массовый учёт населения окраин империи.

Особенность фамилии — её двойное написание. В арабице и кириллице имя Султан пишется через «а», но в тюркских диалектах (особенно в узбекском и таджикском) распространён вариант «Султон» с «о» в первом слоге. Поэтому фамилии Султанова и Султонова — не ошибка, а разные фонетические ветви одного корня. Первая чаще встречается у татар и народов Кавказа, вторая — у среднеазиатских групп. Если ваша фамилия именно Султонова, это может указывать на предков из Ферганской долины или Самарканда.

Никаких данных о принадлежности к конкретному сословию нет: среди носителей были и ремесленники, и земледельцы, и купцы. В советское время фамилия закрепилась через паспортную систему, и сейчас её обладатели живут по всей территории бывшего СССР.