Фамилия Сусенкова — женская форма фамилии Сусенков, и её разумнее разбирать через мужской вариант. Основа фамилии — прозвище Сусенок или Суся. Здесь не обойтись без внимания к суффиксу: -енок (или -ёнок) в русских фамилиях встречается реже, чем -ов или -ин, и обычно указывает на молодость или принадлежность. В древнерусском языке суффикс -енок означал детёныша животного или молодого человека: волчонок, пастушонок. В фамилиях он закрепился за потомками: Сусенков буквально — «сын Суси» или «маленький Суся».

Что такое «Суся»? Тут есть две версии, и обе имеют право на существование. Первая: уменьшительное от крестильного имени Сусанна (в русской традиции — Сусанна, от древнееврейского «шошанна» — лилия). В быту имя сокращали до Суся, а от него образовывали фамилии с суффиксом -енков, как от Ивана — Иваненков, от Петра — Петренков. Вторая версия: прозвище Суся от диалектного глагола «сусить» — в некоторых говорах означало «суетиться», «беспокоиться» или «шалить». Тогда Сусей называли непоседливого, суетливого человека. В ономастике чаще склоняются к антропонимической основе (от имени), потому что прозвища с суффиксом -енок в фамилиях — типичная модель для потомков по отцу.

Географически фамилия Сусенков (и Сусенкова) тяготеет к южнорусским и украинским регионам. Суффикс -енко (украинский вариант) и -енков (обрусевшая форма) особенно распространены на Слобожанщине, в Курской, Белгородской, Воронежской областях. Встречается фамилия и в центральной России, но реже. Сословного барьера у неё не было: Сусенковыми могли быть и крестьяне, и мещане, и казаки — модель образования не выдаёт знатного происхождения.

В написании возможна путаница: Сусенков или Сусёнков. В дореволюционных документах букву «ё» часто заменяли на «е», поэтому точное произношение может различаться. Если фамилия произносится с ударением на второй слог (Сусёнков), то корень «сус» мог быть связан с диалектным «сусло» — сладкое сусло для пива, но это менее вероятно, так как суффикс -енок к «суслу» не крепится логически. Самая правдоподобная история: предок носителя фамилии был Суся — сын или внук Сусанны, либо просто вертлявый мальчишка, за которым закрепилось прозвище.