Фамилия Сусуйкин образована от прозвища Сусуйка, которое, скорее всего, восходит к гидрониму Сусуя. Так называется река одна из двух крупнейших рек на южном Сахалине. Вполне вероятно, что родоначальник Сусйкиных родился или долгое время жил на берегу этого водоема. Само название реки ведет свое начало от айнского слова «сусуя», то есть «проход к скалистому берегу». По другой версии, в основе данного прозвища лежит слово «суса», которое в переводе с персидского языка означает «шелковая и полушелковая полосатая ткань». Серебряная суса известна по халатам. В этом случае прозвище Сусуйка относится к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности основателя фамилии. Исходя из этого, можно предположить, что родоначальник Сусуйкиных был либо портным, либо торговцем сусой. Так и прозвище Сусуя закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Сусуйкин. Таким образом, человек, предка которого звали Сусуйка, со временем получил фамилию Сусуйкин.