Фамилия Сыкунов — один из тех случаев, когда прозвище записано через «ы», хотя на слух оно почти неотличимо от «сикун». Основа здесь — глагол «сикать» (мочиться) или производное от него прозвище Сикун. В старину такие имена не считались грубыми: их давали за характерную привычку, детскую манеру поведения или просто как насмешливую характеристику. Фамилия образована по стандартной восточнославянской модели с суффиксом -ов, который добавлялся к прозвищам на согласный: Сикун → Сыкунов.

Ударение в фамилии чаще всего падает на второй слог — Сыкуно́в, хотя в некоторых говорах могли произносить и Сы́кунов, оттягивая ударение на корень. Важно и написание: в дореволюционных документах букву «ы» после ц и согласных писали последовательно, поэтому фамилия никогда не путалась с вариантом «Сикунов», хотя в устной речи разницы почти нет. Если ваши предки писались через «ы», это указывает на устойчивую грамоту переписчиков или на то, что корень осознавался именно как «сык-» (диалектный вариант «сик-»).

Географически фамилия редкая, но не единичная. Встречается в центральных областях России, особенно в бывших Рязанской и Тамбовской губерниях, где сохранялись архаичные прозвища. Сословного барьера у Сыкуновых не было: носители могли быть и крестьянами, и мещанами, и казаками. В документах XIX века попадаются записи о Сыкуновых из однодворцев — потомков служилых людей, охранявших южные рубежи.

Интересно, что фамилия избежала переосмысления в «Соколов» или «Сычёв», как часто случалось с неблагозвучными прозвищами. Значит, либо носители не стеснялись своего корня, либо фамилия закрепилась в письменной форме достаточно поздно, когда менять её было уже не принято. Параллельных фамилий с той же основой почти нет — можно вспомнить разве что Сыкунчиков, но это уже другая словообразовательная модель.