Фамилия Сыскутова — женская форма фамилии Сыскутов, и её разбор стоит начать с мужского варианта. Сыскутов — это отчество, образованное по стандартной русской модели с суффиксом -ов. В основе лежит прозвище или мирское имя Сыскут. Ключ к пониманию — глагол «сыскать», который в старых говорах означал «найти, отыскать, разыскать». Человек мог получить прозвище Сыскут за способность находить потерянное, за расторопность в поисках или, напротив, за навязчивое любопытство — как «сыщик» в бытовом смысле.

Словообразовательная модель здесь не самая частая. Суффикс -ут в русских прозвищах встречается реже, чем, скажем, -ун или -ак. Он придаёт основе оттенок действия или свойства: «сыск-ут» — тот, кто сыщет, деятель по поиску. Похожие по строению фамилии — например, Свистутов (от «свистеть») или Толкутов (от «толковать»). В случае Сыскутова прозвище могло закрепиться за человеком, который хорошо знал местность, помогал отыскивать беглых крестьян, скот или пропавшие вещи.

Географически фамилия не относится к широко распространённым. Её корни, скорее всего, лежат в северных или центральных регионах России, где диалектное слово «сыскать» было в ходу. В писцовых книгах и переписных листах XVI–XVII веков можно встретить крестьян и посадских с прозвищем Сыскун, но форма на -ут — более редкая и, возможно, локальная. Сословно носители фамилии почти наверняка были из крестьян или ремесленников: дворянские роды с таким окончанием практически не фиксируются.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Сыщиков, Сысков, Сыскин, — то Сыскутов стоит особняком именно из-за суффикса. Он не даёт точного указания на профессию (как, например, Сыщиков — от «сыщик»), а скорее описывает качество человека. Фамилия сохранила редкую глагольную основу в нестандартной обработке, что делает её ценной для историка языка. Сегодня она встречается точечно, в основном на Урале и в Поволжье, что подтверждает миграцию крестьянского населения в XVIII–XIX веках.