Фамилия Сюнякова — женская форма мужской фамилии Сюняков, и её происхождение идёт от прозвища или имени Сюняк. Основа здесь — нестандартная, и это сразу выделяет фамилию из ряда типичных образований от крестильных имён.

Слово «сюняк» в русских говорах — нечастое. В диалектах (прежде всего северных и центральных) так могли называть вялого, плаксивого или обидчивого человека, того, кто «сюсюкает», говорит невнятно или ноет. Второй вариант — от тюркского корня: в татарском и башкирском «сюн» (сөн) означает «любимый», «красивый», а «сюняк» могло быть уменьшительно-ласкательным именем. Именно тюркская версия выглядит правдоподобнее, если учесть, что фамилия встречается в Поволжье и на Урале, где русские и тюркские народы веками жили рядом. В таком случае Сюняк — это прозвище по внешности или характеру, данное с добрым оттенком.

Суффикс -ов в основе Сюняков указывает на типичную модель русских фамилий второй половины XVI–XVII века: «чей?» — Сюняков, то есть сын или потомок Сюняка. Форма Сюнякова — притяжательное прилагательное в женском роде, закрепившееся как фамилия.

Интересная деталь: фамилия довольно редкая, и её носители почти не встречаются за пределами России. Основной ареал — Татарстан, Башкортостан, Кировская и Нижегородская области. Это косвенно подтверждает версию о тюркском заимствовании: именно в этих регионах смешение языков давало такие необычные основы.

Сословно Сюняковы, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Фамилия не дворянская, в родословных книгах не отмечена, а значит, её носители — потомки простых людей, получивших прозвище по бытовой или диалектной черте.