Фамилия Табергенова — редкий случай в русском ономастиконе: её корни уходят не в славянскую, а в тюркскую языковую среду. Основа фамилии — мужское имя Таберген, которое состоит из двух частей: «таб» (от тюркского «тап» — находить, добывать) и «ерген» (мужчина, молодец, жених). В буквальном смысле имя можно перевести как «добытчик» или «нашедший мужчину», но по смыслу оно ближе к прозвищу «находчивый, удачливый парень». Встречается в казахской и каракалпакской антропонимии, где имена с компонентом «ерген» были распространены.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ов- (Таберген + ов + а), что типично для фамилий, которые фиксировались в метрических книгах и документах Российской империи у представителей тюркских народов, принявших православие или живших в смешанных регионах. Окончание -а указывает на женскую форму, то есть Табергенова — это «дочь или жена Табергена». Мужской вариант — Табергенов.

Географически фамилия тяготеет к регионам с компактным проживанием казахов и каракалпаков: Западный Казахстан, Астраханская область, Оренбуржье, а также встречается у ногайцев. В русских переписях XVIII–XIX веков она могла записываться через «а» (Табергенов) или с двойным «н» (Табергеннов), но современное написание закрепилось как Табергенова.

По социальному статусу предки носительницы фамилии, скорее всего, были скотоводами или охотниками, так как имя Таберген давали детям, желая им удачи в добыче пропитания. Встречается и версия, что имя связано с воинской доблестью: «ерген» в некоторых диалектах означало «воин-одиночка». Единого словаря по этой фамилии нет — она отсутствует в фундаментальных трудах Унбегауна и Никонова, что подтверждает её локальный, необщерусский характер.