Фамилия Такишин — редкий пример, где за основу взято имя, редко встречающееся в русской среде. Корень здесь, скорее всего, тюркский или арабо-тюркский. Исходное слово — «Таки» или «Такий», которое может быть краткой формой от имени Такиутдин или Такиулла (от арабского «такый» — благочестивый, набожный). В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) такие имена распространены, и фамилия Такишин могла возникнуть именно в среде татар, башкир или других народов Поволжья и Приуралья.

Суффикс -ин указывает на модель образования от основы, оканчивающейся на гласный или мягкий согласный: Таки → Такишин. В русской патронимической системе это означает «сын Таки» или «потомок Таки». Схема типична для фамилий, которые получали крещёные татары или представители других тюркских этносов, переходившие в православие. Нередко такие фамилии записывались по отцу уже в русской огласовке, поэтому конечный звук «и» перешёл в «ин», а не в «ов».

Географически фамилия тяготеет к регионам с давним татарским населением: Нижегородская область, Ульяновская, Пензенская, а также Башкортостан и Татарстан. В дореволюционных переписях Такишины могли значиться как государственные крестьяне или мещане, реже — купцы. Сословный разброс невелик, и это говорит о том, что фамилия не получила дворянского статуса.

Встречается и менее вероятная версия — от прозвища «Такиш» (от тюркского «такыш» — стук, шум). В этом случае фамилия могла закрепиться за человеком с громким голосом или суетливым нравом. Но имя собственное как основа выглядит убедительнее: фамилии на -ин от имён, оканчивающихся на гласный, — самый частый сценарий для восточных заимствований в русском ономастиконе.