Фамилия Таптыков — редкий случай, когда географическая привязка оказывается надёжнее, чем семантика корня. Если отталкиваться от слова «таптык» в современных тюркских языках, прямой перевод неочевиден: в казахском и башкирском «тапты» — «нашёл», а «таптык» может быть формой глагола со значением «мы нашли». Но прозвище от глагола в первом лице множественного числа — нетипичная для фамилий модель. Куда логичнее искать корень в диалектном или антропонимическом контексте.

Вероятнее всего, основа — тюркское мужское имя Таптык, образованное от корня «тап-» (находить, добывать). В ономастиконе тюркских народов встречаются имена с такой основой: Таптык, Таптан, Таптыбай. Они могли даваться ребёнку, которого «нашли» — то есть долгожданного, родившегося после трудных родов или, по суеверию, «подкинутого» духами. Имя Таптык фиксируется у башкир и татар, и фамилия Таптыков — типичная русская патронимическая форма на -ов, означающая «сын Таптыка».

Интересная деталь: суффикс -ов указывает, что фамилия оформлялась в русской среде, а не в тюркской. Если бы носители оставались внутри башкирского или татарского именослова, фамилия могла бы звучать как Таптыков или Таптык улы (в тюркской модели). Значит, предок Таптыков — человек, носивший имя Таптык, но живший среди русских или принявший православие, отчего его потомки получили фамилию по русскому образцу.

Есть и другая, менее вероятная версия: от прозвища «Таптык», связанного с диалектным словом «таптык» — так в некоторых говорах называли утоптанное место, тропу. Тогда прозвище мог получить человек, живший у дороги, или тот, кто «протоптал» путь — например, первопроходец. Но эта гипотеза слабая: в словарях русских говоров такое слово не зафиксировано широко, а в тюркских языках значение «топтать» передаётся через «тапта-», что дало бы форму Таптаков, а не Таптыков.

Географически фамилия Таптыков встречается в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской и Челябинской областях. Это совпадает с ареалом расселения башкир и татар, где имя Таптык было употребительным. В дореволюционных метрических книгах фамилия фиксируется среди крестьян и мещан, без указания на дворянство. Таким образом, Таптыковы — потомки тюркского рода, получившие фамилию по имени предка в процессе русификации.