Фамилия Таубкин — редкий для России пример фамилии, образованной от немецкого или идишского корня с помощью русского патронимического суффикса -ин. В основе лежит слово «Тауб» (Taub), что с немецкого и идиша переводится как «голубь». В среде еврейского населения Восточной Европы это было распространённое прозвище или искусственное имя, которое могло даваться по библейской символике (голубь — символ мира, чистоты) либо по внешним признакам — например, кроткому нраву или даже седоватому цвету волос (по ассоциации с оперением). Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Таубкин, то есть сын или потомок Тауба.

Словообразовательная модель здесь необычна тем, что в русской среде фамилии на -ин чаще образуются от основ, оканчивающихся на -а/-я (Иванов — от Иван, но Иванин — от Ивана). А Таубкин — от основы на твёрдый согласный, что для -ин нетипично. Это говорит о том, что фамилия сложилась в смешанной языковой среде, где носители идиша адаптировали свою фамилию под русскую патронимическую модель, не меняя корня.

Встречается фамилия в основном у потомков еврейских ремесленников и торговцев из черты оседлости — на территории современной Беларуси, Украины, Польши. В дореволюционных метрических книгах Таубкины фиксировались как мещане или купцы. После революции часть носителей перебралась в крупные города, и к середине XX века фамилия рассеялась по всему СССР.

Стоит отметить, что фамилия Таубкин не имеет отношения к немецкой фамилии Таубе — там суффикс -е указывает на форму именительного падежа, а в русском варианте добавление -ин окончательно «обрусело» фамилию, сделав её неотличимой по структуре от Ивашкина или Петькина.