Фамилия Тишуков образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей — с помощью суффикса -ов, который в XVI–XVII веках закрепился как основной для фамилий, указывающих на родство. В основе лежит имя или прозвище Тишук. Это, в свою очередь, уменьшительная форма от крестильного имени Тихон (от греческого «тихе» — удача, судьба). В народной речи имя Тихон часто сокращали до Тиша, Тишка, а форма Тишук — характерный южнорусский или украинский вариант с суффиксом -ук, указывающим на сына или ученика: Тишук — «маленький Тихон» или «сын Тихона». Позже, при движении носителей на север и восток, эта форма обросла русским суффиксом -ов, дав фамилию Тишуков — «потомок Тишука».

Интересно, что в некоторых говорах слово «тишук» могло иметь и нарицательное значение — так могли прозвать тихого, спокойного или неразговорчивого человека. В этом случае фамилия образована не от имени, а от прозвища по характеру. Обе версии правдоподобны, но первая — от имени Тихон через форму Тишук — встречается чаще, поскольку в документах XVII–XVIII веков множество записей крестьян и посадских людей с именем Тишук, например, в переписных книгах Курской и Воронежской губерний.

Географически фамилия Тишуков наиболее плотно представлена в чернозёмных областях России — Курской, Белгородской, Липецкой, а также на юге Тамбовской. Это прямо указывает на зону бытования украинского суффикса -ук, который в XVI–XVII веках активно проникал в русские фамилии через переселенцев из Малороссии. В отличие от фамилий с суффиксом -ин (Тишин, Тишкин), Тишуков сохраняет редкий переходный элемент: сначала уменьшительная форма на -ук, потом фамильный суффикс -ов. Такое двойное оформление встречается нечасто и делает фамилию диагностическим маркером южнорусского происхождения.

Сословное происхождение Тишуковых, судя по архивным данным, в основном крестьянское и однодворческое. В XIX веке фамилия не была дворянской, не встречается в родословных книгах высшего сословия. Это не делает её менее интересной — напротив, она типична для той массы русского населения, которая получила фамилии позже других, но сохранила в них живую память о личном имени или прозвище предка.