Фамилия Тишукова — женская форма от Тишуков, а та, в свою очередь, образована от мужского личного имени Тишук. Это типичная восточнославянская модель с суффиксом -ук/-юк, которая распространена прежде всего на западе и юге России, в Белоруссии и на Украине. В отличие от фамилий на -ов/-ин, которые часто возникали по принципу «чей сын», формы на -ук указывали на прямую принадлежность: Тишук — это «маленький Тиша» или «потомок Тиши».

Корень здесь — краткая форма канонического имени Тихон. В народной среде Тихон превращался в Тишу, Тишку, Тишука. Само имя Тихон (от греческого «судьба», «удача») было очень популярным в крестьянской и мещанской среде, особенно в XIX веке. Таким образом, основатель рода Тишуковых мог быть сыном или внуком человека по прозвищу Тишук, а тот — просто Тихона.

Интересно, что фамилия Тишукова, хоть и звучит на русский лад, по своей суффиксальной модели тяготеет к белорусской и украинской ономастике. В центральных и северных областях России чаще встречались бы формы Тишин, Тишков или Тихонов. Тишуковы же концентрируются в южнорусских регионах — Курской, Воронежской, Ростовской областях, а также в Белоруссии. Это указывает на то, что предки носителей фамилии, скорее всего, были выходцами из тех мест, где суффикс -ук был нормой.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с древнерусским словом «тишь» — тишина, спокойствие. В этом случае Тишук могло быть прозвищем тихого, неконфликтного человека. Однако имя Тихон даёт более прямое и убедительное объяснение, поскольку прозвища от нарицательных слов с таким корнем встречаются реже, чем производные от крестильных имён.