Фамилия Тобуков — одна из тех, чья основа неочевидна на первый взгляд, и главная интрига кроется именно в корне «Тобук». Сразу скажем: это не тюркское слово «тобук» (колено), хотя такое созвучие часто сбивает с толку. В русской ономастике фамилия Тобуков, скорее всего, восходит к прозвищу или неканоническому имени Тобук, которое, в свою очередь, могло быть вариантом имени Тоболка — уменьшительной формы от крестильного имени Товия (древнееврейское Товия — «благость Господа»). Подобные стяжения — Тобол → Тобул → Тобук — встречаются в народной речи, особенно в северных и сибирских говорах.

Модель образования проста: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Тобуков — сын Тобука. Фамилия фиксируется преимущественно в Поволжье и на Урале, что подтверждает её русское, а не тюркское происхождение: в этих краях было много старообрядцев, которые любили давать детям «домашние» имена, переделанные до неузнаваемости. Встречается и более редкая версия — от прозвища Тобу́к, связанного с диалектным глаголом «тобу́чить» (шуметь, буянить). В таком случае предок мог получить фамилию за характер.

Спорный момент — возможная связь с татарским «тубык» (колено). Если бы фамилия была тюркской, она скорее писалась бы как Тубуков или Тубеков и имела бы иное распространение. Тобуков же — фамилия славянская по суффиксу и бытовая по духу: её носили крестьяне и посадские люди, а не знать. В документах XVIII–XIX веков встречаются Тобуковы среди однодворцев Воронежской губернии и мещан Пермской — это и есть та самая географическая привязка, которая делает версию с «Товией» наиболее убедительной.

Таким образом, ваш предок, скорее всего, носил простонародное имя Тобук, образованное от церковного Товия, а фамилия закрепилась за его потомками как стандартная русская патронимическая форма. Никакой экзотики — только живая народная этимология, которая превратила библейское имя в нечто, звучащее по-домашнему.