Фамилия Токатян — яркий пример армянской модели фамилии, образованной с помощью суффикса -ян (-янц). Этот суффикс, означающий «из рода кого-то» или «принадлежащий к», — самый распространённый в армянской ономастике, он заменил более древний суффикс -янц, указывавший на происхождение от предка. В основе фамилии лежит личное имя или прозвище Токат (Токат), которое, скорее всего, восходит к армянскому слову «токат» — «горячий», «пылкий» или «вспыльчивый». Первоначально так могли прозвать человека с живым, нетерпеливым нравом.

Есть и другая, менее вероятная, но исторически любопытная версия. Токат — это название города в центральной Турции, древней Евдокии. В таком случае фамилия Токатян могла указывать на выходца из этого региона. Однако для армянских фамилий топонимическая основа с суффиксом -ян встречается реже, чем прозвищная или именная, поэтому версия с характеристикой человека выглядит убедительнее.

Фамилия Токатян не фиксируется в классических русских словарях фамилий (Унбегауна, Веселовского), что неудивительно: она типично армянская и входит в массив фамилий, массово появившихся в России в XIX–XX веках вместе с миграцией армян. Сословно её носители могли относиться к разным группам — от ремесленников и торговцев до крестьян, так как армянский суффикс -ян универсален и не указывает на знатность.

В написании фамилия устойчива: ударение, как правило, падает на последний слог — Токатя́н. Вариант Токатянц встречается, но реже и считается более архаичным. В русском языке фамилия не склоняется, если принадлежит женщине, и склоняется по падежам, если речь о мужчине: «письмо от Токатяна», «встреча с Токатяном».