Фамилия Токсаров — одна из тех, где ясна модель образования, но тёмным остаётся корень. Скорее всего, она происходит от прозвища или имени Токсар, которое в русском языке не встречается, а значит, почти наверняка пришло из тюркских языков. Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — Токсаров, то есть сын или потомок человека по имени Токсар.

Вероятнее всего, в основе лежит тюркское имя Токсар, где «ток» — «сытый, полный, достаток», а «сар» — «жёлтый, белый» или в переносном смысле «знатный, благородный». В тюркской ономастике такие двухчастные имена часты, и они могли обозначать человека счастливой судьбы или высокого происхождения. Менее убедительна версия, что Токсар — это искажённое «токарь»: для профессии в русском языке есть форма Токарев, а не Токсаров, и замена «к» на «кс» нехарактерна.

Фамилия редкая и географически не привязана к одному региону, но носители встречаются в Поволжье и на Урале — как раз в зоне длительного русско-тюркского контакта. Это косвенно подтверждает версию о тюркском происхождении. Сословно предки Токсаровых, скорее всего, были крестьянами или служилыми людьми: в дворянских родословных книгах фамилия не зафиксирована.

В написании стоит обратить внимание на ударение: по правилам русских фамилий на -ов оно падает на последний слог — Токсарóв, хотя в устной речи иногда смещается на первый.