Фамилия Токуева — женская форма мужской фамилии Токуев, и её разбор стоит начать с суффикса, который встречается не так часто, как привычные -ов или -ин. Суффикс -ев указывает на принадлежность к роду по отцу: Токуев — сын или потомок человека по имени или прозвищу Токуй. Такая модель типична для тюркских народов, где фамилии на -ев/-ов активно формировались в XIX—XX веках при переходе к паспортной системе.

Основа фамилии восходит к тюркскому личному имени Токуй или прозвищу Току. В тюркских языках слово «ток» имеет несколько значений: сытый, довольный, а также — в более архаичном пласте — спокойный, мирный. Имя Токуй могло даваться ребенку как пожелание сытой и благополучной жизни. В казахском, башкирском и татарском антропонимиконах встречаются имена с корнем «ток» — например, Токтар, Токсанбай. Фамилия Токуев/Токуева чаще всего фиксируется у представителей этих народов, особенно в Оренбургской, Челябинской областях и в Башкортостане.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с монгольским словом «тогой» (или «токуй») — «знамя», «стяг». В таком случае Токуй могло быть прозвищем воина или предводителя. Но эта гипотеза слабее, так как в тюркских языках, откуда фамилия явно происходит, корень «ток» в значении «сытость» встречается гораздо чаще и имеет прямые параллели в именах.

По социальному происхождению носители фамилии Токуева в основном относятся к крестьянскому или казачьему сословию, но без документальных свидетельств утверждать что-то конкретное сложно. В архивных записях XIX века фамилия встречается среди башкирских и татарских крестьян Уфимской губернии. Сегодня Токуева — фамилия редкая, и её носители живут не только в России, но и в Казахстане, где она тоже имеет тюркские корни.