Фамилия Толкушев образована от прозвища Толкуш. Его основа — глагол «толочь» в одном из переносных значений. В русских говорах «толкуш» или «толкуша» называли человека, который много и попусту говорит, «толчёт воду в ступе» — отсюда современное «толковать» и «толк» в смысле смысла. Но есть и более конкретная версия: в северных и сибирских диалектах «толкуш» — это деревянная ступка или пест для толчения зерна, соли, табака. Прозвище могли дать либо болтуну, либо тому, кто постоянно работал с такой утварью, например, на мельнице или в заготовке круп.

Суффикс -ев указывает на притяжательную модель: Толкушев буквально значит «сын Толкуша». Это типичная патронимическая фамилия, возникшая в XV–XVII веках в среде крестьян и посадских людей. Интересно, что однокоренные фамилии Толкачёв и Толкунов встречаются чаще, а Толкушев — более редкая, локальная форма. Возможно, она закрепилась в регионах, где бытовала именно форма «толкуш», а не «толкун» или «толкач».

По данным современных справочников, фамилия Толкушев встречается в основном в Поволжье и на Урале, особенно в Пермском крае и Кировской области. Это косвенно подтверждает связь с северорусскими говорами, где слово «толкуш» было в ходу. Первые письменные упоминания можно искать в писцовых книгах XVI века, но точных записей именно этой фамилии в ранних источниках не сохранилось — в переписях чаще фиксировали прозвища, а фамилии оформились позже.

Дворянских родов с фамилией Толкушев не зафиксировано. Она осталась в крестьянской и мещанской среде. В XIX веке носители фамилии могли быть мельниками, крупорушниками или просто людьми с живым языком — прозвище не обязательно несло отрицательный оттенок. В некоторых областях «толкуш» называли того, кто умел доходчиво объяснять, «толковать» дело, так что фамилия могла закрепиться за грамотным или речистым крестьянином.