Фамилия Толкушева — женская форма фамилии Толкушев, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или мирским именем Толкуш. Основа здесь — глагол «толкать» или «толочь», но не в грубом, бытовом смысле, а скорее в профессиональном или прозвищном ключе. В русских говорах «толкуша» — это не только та, кто толчёт что-либо (например, зерно в ступе), но и человек суетливый, непоседливый, «толкущийся» без дела. В ономастике эта модель типична: суффикс -уш- (как в «вертуша», «крикуша») образовывал прозвища по действию или характеру, а затем фамилии на -ев/-ов закрепили за потомками это имя.

Менее очевидная, но более узкая версия — связь с диалектным словом «толкуша» в значении «мельничный постав» или «ручная мельница». Тогда Толкушей могли прозвать мельника или работника, занятого помолом. В пользу этого говорит тот факт, что фамилии, образованные от названий инструментов или орудий труда (ср. Топоров, Молотов), встречаются реже, чем от личных качеств, но зато дают точную ремесленную привязку. Судя по географическому распространению, корни фамилии тянутся в центральные и северные области России, где было развито мукомольное дело, — в Вологодчину, Костромскую губернию. Там же фиксируются и однокоренные фамилии Толкачёв, Толчеев, указывающие на ту же профессиональную нишу.

Что касается сословной принадлежности, то Толкушевы — почти наверняка крестьянская или посадская фамилия. Дворянские роды с таким окончанием (-ев) редки и обычно ведут начало от духовенства или служилых людей, но здесь основа слишком «низовая», ремесленная. Словообразовательная модель проста: прозвище Толкуш (на -а, мужское) + притяжательный суффикс -ев, что значит «сын Толкуша». В документах XVII–XVIII веков такие фамилии нередко записывали через «о»: Толкушов, что тоже встречается, но форма Толкушев — более поздняя, с закреплением «е» в безударном положении.