Фамилия Томчинкий — одна из тех, что ставит перед исследователем загадку уже на уровне написания. В ней явно читается суффикс -ский, типичный для польской, украинской или белорусской шляхты, а также для русских фамилий духовенства и дворянства. Однако основа «Томчинк-» нестандартна. Скорее всего, перед нами не опечатка, а результат адаптации фамилии в русском языке — от более привычной формы Томчинский или Томчицкий.

Корень фамилии — «Томк-», восходящий к уменьшительной форме имени Фома (в народных вариантах — Тома, Томко). В польской и украинской традициях суффикс -инк-/-енк- часто указывал на происхождение от отца: Томчинко — это «маленький Тома», сын Томки. Затем, при переходе в русскую среду, к основе добавили типичный для великорусских фамилий суффикс -ий (-ский), который в просторечии мог редуцироваться до -кий. Таким образом, Томчинкий могло означать «сын Томчинка», то есть внук или потомок человека по имени Томко (Фома).

Вероятно, фамилия имеет западнорусское или белорусское происхождение, где звучала как Томчинский. Носители могли быть выходцами из мещан или мелкой шляхты, получившими фамилию по месту жительства (село Томчин) или по отцу. Сложное сочетание согласных «нчк» — признак того, что фамилия прошла через устную передачу, где «ч» смягчалось, а «н» выпадало. В документах XIX века такую фамилию могли записать на слух, как слышал писарь, отсюда и редкий вариант с «к» вместо «ц» или «ск».