Фамилия Томишина — женская форма, а её мужской вариант — Томишин. Это относительно редкая фамилия, и её происхождение стоит разбирать через суффикс и основу, а не через стандартную географию.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Томишин, то есть сын или потомок человека по прозвищу или имени Томиша. Сама основа Томиш- — это, скорее всего, уменьшительно-ласкательная или обиходная форма от крестильного имени Фома (от арамейского «близнец»). В русской народной традиции имя Фома давало множество производных: Фомка, Фомушка, а в южнорусских и украинских говорах — Тома, Томила, Томиш. Форма «Томиш» могла возникнуть через смягчение «Фом» в «Том» (как Фёдор — Тодор) и добавление суффикса -иш, который придаёт оттенок уменьшительности или, реже, пренебрежительности.

Вторая, менее вероятная версия выводит фамилию от нецерковного прозвища Томиша, связанного с глаголом «томить» — мучить, истощать. В этом случае прозвище могли дать человеку медлительному, нудному или тому, кто сам много терпел. Но для такого значения более типичны формы Томило, Томила, а «Томиша» — редкий вариант, поэтому версия с именем Фома выглядит правдоподобнее.

Ономастические словари (например, работы Б. Унбегауна) фиксируют фамилию Томишин как одну из производных от Фомы, наряду с более частыми Томиловым и Томиным. Встречается она в основном в центральных и южных регионах России, а также на Украине, что совпадает с ареалом, где имя Фома произносили через «Т».

Исторически носители фамилии Томишин — это, скорее всего, крестьяне или посадские люди, получившие фамилию по отцу или деду, которого в быту звали Томиша. Сословной элиты среди них не было: фамилии на -ин у дворян встречались, но Томишин к их числу не относится. Если искать однокоренные фамилии, то это Томин, Томилов, Томилин — все они восходят к тому же корню.