Фамилия Топоченок выделяется на фоне типичных русских фамилий своим необычным суффиксом -ёнок. В русском языке этот суффикс традиционно указывал на «детёныша» или «маленького»: волчонок, лисёнок. В фамилиях он закрепился в основном на белорусских и западнорусских землях (Смоленщина, Псковщина) и означал «сын того-то» или «младший родственник». То есть Топоченок — это буквально «сын Топоча» или «маленький Топоч». Основа здесь — прозвище или некалендарное имя Топоч.

Само слово «топоч» восходит к глаголу «топать» — топать ногами, стучать, идти тяжело. Такое прозвище мог получить человек с тяжёлой походкой, шумный, неуклюжий, или же тот, кто часто сердито топал ногами (например, в сердцах). В говорах «топотун» означало ещё и суетливого, хлопотливого человека. Есть и менее очевидная, но возможная связь с диалектным «топочь» — шум, гам, суматоха. Тогда прозвище могли дать крикливому, беспокойному человеку.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто носили крестьяне центральной России, фамилии на -ёнок (Топоченок, Козлёнок, Рыжонок) долгое время оставались полуофициальными, семейными прозвищами. В метрические книги их заносили реже, а в ревизских сказках — только если крестьянин не имел устоявшейся фамилии по отцу. Поэтому носители Топоченок — это, скорее всего, потомки белорусских или смоленских крестьян, которые получили фамилию не от помещика, а от односельчан, по характерной черте или поведению предка.

Двойников у фамилии немного. Если бы основа была от имени Фотий или Фока, мы бы увидели вариант «Фоточёнок», а не «Топоченок». Так что корень тут именно звукоподражательный и бытовой, без церковного или книжного следа. Встречается фамилия в основном в Витебской и Могилёвской областях Беларуси, а также в приграничных районах России — там, где суффикс -ёнок был нормой для образования «сыновьих» фамилий.