Мужское крестильное имя Трофим в переводе с древнегреческого означает «кормилец». В основу фамилии легла производная форма имени - Трофимка. Скорее всего, основатель рода Трофимкиных был выходцем из крестьянской или рабочей среды. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Трофимка, со временем получил фамилию Трофимкина.