Фамилия Трубко — звонкий пример того, как прозвище по ремеслу или внешности закрепилось в родовом имени. Её основа — слово «труба» в одном из множества бытовых значений. Скорее всего, предок носителя фамилии имел дело с трубами: был печником, складывал печные дымоходы, работал в кузнице (где труба — часть горна) или служил трубачом. В некоторых говорах «трубой» называли и долговязого, худого человека, так что прозвище могло быть чисто внешним.

Особенность фамилии — суффикс -к- и окончание -о. Это типичная украинская или южнорусская модель образования фамилий от прозвищ на -ко (Трубко, Дудко, Сопелко). В украинской ономастике такие фамилии часто указывают на лицо мужского пола, а окончание -о со временем застыло и не склоняется по падежам, как в русском языке. Если бы фамилия возникла в северных или центральных областях России, она скорее получила бы суффикс -ов: Трубов.

Встречается Трубко в основном на Украине и в южных регионах России, особенно в бывших казачьих областях. В реестрах запорожских казаков XVII–XVIII веков нередки прозвища, образованные от названий музыкальных инструментов или ремесленных приспособлений, и Трубко могло быть одним из них. Менее вероятная, но возможная версия — связь с личным именем Труфон (Трифон), где «Труб» — сокращённая форма, а -ко — уменьшительный суффикс. Однако для этой гипотезы нет убедительных письменных подтверждений, и ремесленная версия остаётся основной.

Слово «трубка» в русском языке имело и переносное значение — курительная трубка. Прозвище Трубка мог получить заядлый курильщик или мастер, делавший такие трубки. Но от «трубка» фамилия звучала бы как Трубкин, а не Трубко. Таким образом, исходное слово — именно «труба».