Фамилия Труненкова образована от прозвища Труня — так в старину могли назвать человека с необычным характером или занятием. Чтобы понять, что стояло за этим прозвищем, стоит заглянуть в диалектные словари: в вологодских говорах слово «трун» означало «отрепье, ветошь», а в беломорских — «вид камбалы». Отсюда и две версии происхождения.

Если опираться на первое значение, прозвище Труня относилось к числу «профессиональных» именований: так могли прозвать старьевщика, человека, который скупал или подбирал ветошь. Во втором случае прозвище указывало бы на рыбака, промышлявшего камбалой на Белом море. Обе версии правдоподобны, но первая выглядит убедительнее: прозвища от названий ремесленников встречаются чаще, чем от названий рыб, да и география вологодских говоров шире.

Сама модель фамилии простая и распространённая: прозвище Труня оформилось суффиксом -енков, который указывал на родство — «сын Труни». Со временем форма Труненков закрепилась за потомками, а женский вариант Труненкова — за их жёнами и дочерьми. Такая схема типична для северорусских и поволжских фамилий, где суффикс -енков/-онков был особенно популярен в XVI–XVII веках.

Интересно, что фамилия сохранила не только корень, но и редкий для литературного языка суффикс: более привычными были бы формы Трунин или Трунов, но Труненков встречается заметно реже. Это делает фамилию ценным источником семейной истории — по ней можно проследить, откуда пошёл род и чем занимался его основатель. Передаваясь из поколения в поколение, фамилия по сей день хранит память о происхождении индивида, пусть и в форме, которая требует расшифровки.

Точных сведений о конкретных носителях фамилии в открытых источниках мало, но это не мешает увидеть за ней живого человека — старьевщика или рыбака, которого в его деревне знали под коротким прозвищем Труня.