Фамилия Трышканова — женская форма фамилии Трышканов. Её основа восходит к прозвищу или неканоническому имени Трышкан, которое, в свою очередь, образовано от имени Трышка — уменьшительной формы крестильного имени Трифон. В русской народной традиции имена часто усекали и добавляли суффикс -к(а), так Трифон превращался в Трышку, а далее — с помощью суффикса -ан, обозначающего лицо, — в Трышкана. По другой, менее вероятной версии, в основе может лежать диалектное слово «трышка» — так в некоторых говорах называли мелкую монету или человека, который торгуется по мелочам. Однако фонетика фамилии (с ударением на второй слог) и её суффиксальная модель говорят в пользу происхождения от имени.

Модель образования с суффиксом -ан (-ан-ов) характерна для северных и центральных областей России. Такие фамилии часто фиксировались в Новгородской, Вологодской, Архангельской губерниях, где «Трышкан» могло быть внутрисемейным прозвищем старшего сына или просторечным именем. Суффикс -ов в окончании указывает на принадлежность: Трышканов — «сын Трышкана», что типично для русских фамилий, сложившихся к XVII–XVIII векам.

В документах фамилия встречается редко, что говорит о её локальном бытовании. Скорее всего, предки носительницы фамилии были крестьянами или посадскими людьми, а само имя Трышкан не вышло за пределы узкого круга односельчан. Ономастический словарь Б. Унбегана относит подобные образования к «полуименам» — неканоническим формам, которые не попали в святцы, но активно использовались в быту. Таким образом, Трышканова — фамилия, сохранившая память о простонародном варианте церковного имени Трифон, и её редкость делает её особенно ценной для генеалогического поиска.