Фамилия Цинеев — редкий случай, когда внешне тюркская основа сочетается с русским суффиксом принадлежности. Скорее всего, в её основе лежит прозвище или имя Циней, которое образовано от тюркского слова «цин» (чин, достоинство, ранг) или от имени Чингиз (в усечённой форме). Суффикс -ев указывает на типичную русскую модель: «чей?» — Цинеев, то есть сын или потомок Цинея.

Менее вероятна, но возможна версия, что основа восходит к диалектному русскому слову «циня» (так в некоторых говорах называли скупого или прижимистого человека). Однако в этом случае фамилия скорее имела бы форму Цинин (от слова на -а). Форма Цинеев указывает на основу мужского рода, поэтому прозвищная версия слабее.

Географически фамилия встречается в Поволжье и на Урале — регионах, где веками соседствовали русские и тюркские народы. Это объясняет появление фамилий, где тюркское личное имя или прозвище обрастало русским окончанием. Носители Цинеевых могли быть крещёными татарами, башкирами или русскими, получившими прозвище от соседей.

В словарях фамилия не зафиксирована, что подтверждает её редкость. По той же модели образованы фамилии Чинеев, Чинёв, Цинёв — все они восходят к одному корню, но различаются суффиксами и огласовкой. Если в вашей семье сохранилось предание о происхождении, оно может прояснить, какая из версий верна именно для вашего рода.