Фамилия Ципан относится к сравнительно редким и неоднозначным по происхождению. Её основа — «цип» — может восходить к разным источникам, и чтобы понять, кем были предки, стоит разобрать два основных направления.

Первый и самый вероятный вариант — прозвище от глагола «ципать» (диалектный вариант слова «щипать», распространённый в южнорусских и украинских говорах). В этом случае Ципан — человек, занимавшийся щипанием: либо работник, обрабатывающий лён или пеньку (щипальщик), либо тот, кто обирал, «щипал» птицу. Слово могло закрепиться и за прижимистым, мелочным человеком, который «щиплет» каждую копейку.

Второй вариант, менее очевидный, но имеющий право на существование, — связь с тюркским «чипан» (разновидность верхней одежды, халат). В этом случае прозвище могли дать человеку, носившему такую одежду, либо торговцу ею. Однако для фамилии Ципан, в отличие от, скажем, фамилии Чипанов, этот корень менее типичен, так как звук «ц» в русском языке редко появляется из тюркского «ч» без посредничества диалектов.

По модели образования фамилия типична для восточнославянского ареала: основа «Цип» плюс суффикс -ан, который в украинских и белорусских фамилиях часто указывает на лицо по действию или характерному признаку (ср. Дерган, Стукан, Топтан). В русской традиции такой суффикс встречается реже, что может указывать на западнорусские или украинские корни рода.

Географически фамилия Ципан встречается в основном на западе России (Брянская, Смоленская области), а также на востоке Украины и в Беларуси. Это косвенно подтверждает версию о диалектном «ципать»: именно в этих регионах слово бытовало активно.

В дореволюционных документах фамилия почти не фиксируется в дворянских родословных. Скорее всего, это фамилия крестьянская или мещанская, образованная от уличного прозвища. Человек с такой фамилией мог быть ремесленником, обрабатывающим лён, или просто человеком с цепким, «щиплющим» характером.